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西北农林辛东芸、蓝贤勇等:已报道的全基因组选择性消除分析中发现IGF2BP2基因的插入缺失变异与山羊产羔数相关

发布时间:2022-05-06 17:58:05 来源:雷泽竞猜平台 作者:雷泽竞猜

  原标题:西北农林辛东芸、蓝贤勇等:已报道的全基因组选择性消除分析中发现IGF2BP2基因的插入/缺失变异与山羊产羔数相关

  目的:验证IGF2BP2插入/缺失与陕北白绒山羊产羔数之间的关系,并选择有利的等位基因。

  创新点:首次筛选、验证山羊IGF2BP2基因的InDel位点,确定其与山羊产羔性状的相关性及作用,为山羊经济性状改良及新品种培育提供理论依据。

  方法:采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)方法分析IGF2BP2在单羔组和多羔组中的表达水平;通过PCR扩增-琼脂糖凝胶电泳在918只陕北白绒母山羊中鉴定IGF2BP2基因P4-Ins-13bp和P5-Del-12bp缺失/插入位点基因型,并进行测序以验证突变;利用SHEsis平台分析两个位点的连锁不平衡;采用方差分析(ANOVA)和χ2检验分析山羊IGF2BP2基因变异与产羔数的关系;并利用在线数据库预测转录因子(TF)和突变区域序列的结合。

  结论:本研究发现,IGF2BP2的mRNA表达水平在单羔组明显高于多羔组。在陕北白绒母山羊中验证了IGF2BP2基因内的插入/缺失(indels),包括P4-Ins-13bp和P5-Del-12bp。χ2检验表明,P4-Ins-13bp基因型(χ2=14.479,P=0.006)在单羔和多羔组间分布差异显著;相关分析表明,P4-Ins-13bp与山羊产仔数显着相关(P=0.022),具有缺失/缺失(DD)基因型的山羊个体产仔数高于其他山羊。因此,IGF2BP2基因的P4-Ins-13bp突变可作为一种潜在的与繁殖性状显著相关的分子标记,以优化母羊繁殖力,提高山羊产业的经济效益。

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